Odbor Administrace ROP se člení na tato oddělení:

• oddělení Administrace projektů,
• oddělení Metodická podpora,
• oddělení Technická pomoc a publicita.

Součástí odboru mohou dále být zaměstnanci přímo podřízení vedoucímu odboru. Náplň činnosti odboru Administrace ROP je stanovena v členění na jednotlivá oddělení takto: 

oddělení Administrace projektů zejména:

• spolupracuje na vypracování postupů a navrhuje úpravy v metodických postupech upravujících administraci, hodnocení a výběr projektů,
• připravuje Smlouvu o poskytnutí dotace a zajišťuje její uzavření,
• plní funkci kontaktního místa pro poskytování informací o podmínkách ROP formou osobních, telefonických, či elektronických konzultací,
• zajišťuje poskytování informací a metodické podpory potenciálním příjemcům,
• spolupracuje při přípravě výzev pro příjem žádostí,
• zajišťuje příjem a registraci Žádostí o poskytnutí dotace,
• zajišťuje kontrolu formálních náležitostí a kontrolu přijatelnosti projektů,
• zajišťuje hodnocení projektů,
• zajišťuje provádění analýzy rizik projektů,
• zajišťuje externí posouzení projektů,
• zajišťuje výběr projektů (tj. zajišťuje přípravu podkladů ke schválení výběru projektů výborem),
• administruje výběr projektů (tj. zasílá informace o výsledcích žadatelům),
• zajišťuje příjem, kontrolu formálních náležitostí, kontrolu přijatelnosti a hodnocení projektů TP,
• zajišťuje příjem, kontrolu formálních náležitostí, kontrolu přijatelnosti a hodnocení integrovaných plánů rozvoje měst,
• spolupracuje při nastavení postupů pro administraci, výběr a realizaci projektů,
• spolupracuje při vypracování kriterií pro výběr financovaných projektů,
• zajišťuje zadávání dat o žádostech/projektech do monitorovacího IS (dále jen „monitorovací IS“),
• zajišťuje vypracování podkladů pro potřeby monitoringu a evaluací,
• spolupracuje na zadávání a realizaci projektů TP týkajících se činnosti oddělení,
• spolupracuje na vypracování plánu TP,
• vykonává další činnosti stanovené Operačním manuálem ROP a vnitřními předpisy.

oddělení Metodická podpora zejména:

• zajišťuje vypracování programového a prováděcího dokumentu ROP a jejich aktualizace,
• zajišťuje vypracování systému metodik a postupů pro subjekty implementační struktury ROP,
• zajišťuje vypracování systému metodik a postupů pro žadatele a příjemce ROP,
• zajišťuje nastavení celého systému metodik a postupů v rámci ROP a jeho řízení,
• zajišťuje nastavení postupů pro metodickou podporu ROP v rámci závazné řídící dokumentace a řízení změn,
• zajišťuje nastavení postupů pro monitoring v rámci ROP a řízení změn,
• zajišťuje nastavení postupů pro evaluaci v rámci ROP a řízení změn,
• zajišťuje nastavení postupů pro nesrovnalosti v rámci ROP a řízení změn,
• zajišťuje nastavení postupů pro administraci, hodnocení a výběr projektů v rámci ROP a řízení změn,
• zajišťuje nastavení postupů pro kontroly v rámci ROP a řízení změn,
• zajišťuje nastavení postupů pro realizaci projektů v rámci ROP a řízení změn,
• zajišťuje nastavení postupů pro proplácení a certifikaci plateb v rámci ROP,
• zajišťuje nastavení postupů pro komunikaci a publicitu v rámci ROP a řízení změn,
• zajišťuje nastavení postupů pro TP v rámci ROP a řízení změn,
• zajišťuje nastavení postupů pro budování absorpční kapacity v rámci ROP a řízení změn,
• zajišťuje nastavení kriterií pro výběr financovaných operací, vč. jejich zařazení do relevantní dokumentace,
• zajišťuje aktualizaci metodik a postupů pro subjekty implementační struktury ROP,
• zajišťuje aktualizaci metodik a postupů pro žadatele a příjemce ROP,
• zajišťuje podporu při výkladu metodiky a postupů pro subjekty implementační struktury ROP,
• zajišťuje podporu při výkladu metodik a postupů pro žadatele a příjemce,
• zajišťuje provázanost metodik a postupů pro ROP s metodikami NOK a metodikami Ministerstva financí,
• zajišťuje vypracování podkladů pro potřeby monitoringu týkajících se činností metodického řízení,
• zajišťuje zveřejnění metodik a postupů pro ROP a jejich distribuci příslušným subjektům,
• zajišťuje zpracování podkladů pro certifikaci výdajů,
• metodicky zajišťuje plnění funkce manažera rizik ROP,
• spolupracuje na zadávání a realizaci projektů TP týkajících se činnosti oddělení,
• spolupracuje na vypracování plánu TP,
• vykonává další činnosti stanovené Operačním manuálem ROP a vnitřními předpisy.

oddělení Technická pomoc a publicita zejména:

• spolupracuje na vypracování prostupů a navrhuje úpravy v metodických postupech týkajících se činnosti oddělení, tj. upravujících TP, absorpční kapacitu a publicitu (včetně komunikačních aktivit),
• zajišťuje přípravu a realizaci projektů TP, včetně projektů týkajících se absorpční kapacity,
• zajišťuje vypracování, řízení, monitorování a vyhodnocení rámcového a ročních plánů TP,
• zajišťuje účast na pracovní skupině NOK (k TP a publicitě),
• zajišťuje koordinaci TP v rámci implementační struktury ROP,
• podílí se na přípravě zadávání projektů TP v souladu s plánem (externím dodavatelům),
• spolupracuje na hodnocení a výběru dodavatelů pro projekty TP,
• zajišťuje realizaci projektů TP (vč. kontroly dodavatelů),
• zajišťuje vypracování podkladů týkajících se TP pro potřeby monitoringu a evaluace,
• zajišťuje vypracování, realizaci a vyhodnocování Komunikačního plánu ROP (dále jen „KoP“),
• zajišťuje vypracování, realizaci a vyhodnocování ročních KoP,
• zajišťuje realizaci komunikačních aktivit dle KoP,
• zajišťuje využívání komunikačních a informačních nástrojů dle KoP,
• zodpovídá za evidenci a uložení veškeré dokumentace o provedených informačních a propagačních opatřeních,
• provádí sběr dat, sledování indikátorů a vyhodnocení realizace KoP a ročních KoP,
• zodpovídá za sledování a vyhodnocení efektivnosti a kvality jednotlivých informačních a propagačních opatření a nástrojů,
• zodpovídá za zpracování informací vztahujících se ke KoP, ročním KoP a  k dalším  skutečnostem v oblasti informování a publicity pro účely monitoringu a evaluace,zajišťuje organizaci informačních a vzdělávacích akcí k ROP,
• zajišťuje distribuci informačních a propagačních materiálů k ROP,
• zajišťuje tvorbu a provoz webových stránek ROP (po věcné stránce),
• zajišťuje zveřejnění seznamu schválených projektů a příjemců pomoci z ROP,
• zajišťuje dodržování pravidel legislativy ES a pravidel ROP pro publicitu při provádění informačních a komunikačních opatření ze strany ŘO ROP,
• zajišťuje poskytování informací o ROP,
• zajišťuje činnosti související s realizací Komunikačního akčního plánu Společného regionálního operačního programu (dále jen „SROP“),
• zajišťuje činnosti souvisejících s TA SROP a s projektem 3.3 SROP,
• vykonává další činnosti stanovené Operačním manuálem ROP a vnitřními předpisy.